《鐵臂阿童木：阿童木心之秘密》是 Game Boy Advance 上的動作橫向卷軸遊戲，玩家將操控阿童木迎戰敵人、穿越關卡，並隨著故事發展揭開事件真相。戰鬥融合拳腳攻擊與飛行能力，並可結識不同角色，逐步解鎖更多故事內容。